磁化水在工业、农业等领域有广泛的应用。在工业上，人们最初只是用磁场处理少量的锅炉用水，以减少水垢。

普通电热水器使用时间长了之后，需要对储水箱进行清洗，水垢附在内胆，加热后的热水对人体有害。同时水垢聚结会对电阻丝的加热不均产生爆裂，造成安全事故。 由于高速变化磁场的振荡，使水垢无法生成，这也是为什么那么多人会选择磁能热水器的原因。

磁能热水器的加热水使水流通过一个磁场，经过磁场切割后的水中的钙镁盐类不能结垢或不能结成坚硬的水垢，而是呈现松散的微小颗粒，随水流运动，经过沉淀装置沉淀后排除。

磁场的作用使碳酸钙的结构形态发生了改变，从晶态结构变成无定形结构，质地松散并不易聚积。磁化导致水结构疏松并使它的结构有所调整。其本质是水流经过磁场时，磁化导致水分子与其他离子自身极化，一方面改变了水分子间缔合状态，使大的缔合水分子变成单个水分子，改变了水与水中离子、微晶间的水合状态，单个的水分子把成垢的阴阳离子紧密包围，使其不能凭借成垢的阴阳离子之间的静电引力结合成垢；通过结果分析了磁化处理对离子水合反应的影响，定性地找出磁化过程对离子水合的作用趋势，离子水合程度愈强。水有很强的溶解性，没有经过磁化处理的水中离子不是以单独的游离状态存在，而是以水合离子的形态存在，经过磁化处理的液体中游离的单个分子数目得以增加，自由化的水分子占据了溶液的各个空隙，抑制了结晶晶体的生成。

另一方面磁化使水中其他杂质极性发生改变，相互之间不易引起水聚结沉淀物质。磁化作用改变了钙、镁分子的电特性和物理特性，从而改变了钙、镁分子之间和钙、镁分子与其他任何表面的粘附特性，使得结垢晶核减少并不易长大，即使已成的结垢也呈单个的微小颗粒，不易粘附在管道壁内上或设备内。易随水流运动经过循环系统不断地溶解，被水流冲走。

高频磁化水增加了水的活性，改变了水分子与其它离子的结合状态，磁能热水器在刚推出来的时候就获得了很大的成功，很多人就是奔着这个没有水垢去的。